软件标签:LigandScout
LigandScout是一个领先的分子设计解决方案,提供领先的工具和简单的设计,轻松进行各种复杂的操作,完整复杂的评估、设计以及合成等操作,这里有丰富的工具和贴心的设计,不管您是要进行多复杂的项目都能为您提供更具效率的工作过程,更准确的预测和更严谨的分析,解决问题并提高生产力,让用户更具信心的在专业领域中进行每一个步骤。
版本特色
基于结构的药效团建模
基于配体的药效团建模
筛选库生成
虚拟放映
模型验证(自动ROC曲线)
扩展表过滤和导出
高速3D Conformer生成器
Tautomer发生器
基于药效团的比对和聚类
2D分子编辑器
交互式分子性质图
蛋白质结合袖珍查找器
交互式分子对接
交互式配体结合亲和力估计
自动载脂蛋白位点药效团发生器
分子动力学轨迹导入
交互式MD轨迹分析图
Inte:配体键延长
远程集群或亚马逊云计算
用于筛查的预先计算的3D库
功能特色
1、基于结构的 3D 分子设计
ligandscout screen shot使用几何结构、字典和规则自动解析 PDB 配体
最先进的用户界面,具有先进的 3D 图形和撤消功能
直接连接到 3D 界面的 2D 视图和层次视图
分子的生物活性构象与其他分子和来自多个配体和/或药效团的 3D 药效团快速对齐,可以得出共同特征的药效团来理解和建模相关的作用模式
对辅因子、离子、水分子和共价结合配体的高级处理
为更有经验的用户提供广泛的参数控制
先进的 PDB 配体感知和在活性位点建模时轻松的手动校正
能够将辅因子和水分子作为配体的一部分或大分子的一部分进行处理
基于药效团的直观分子对齐
支持最常见的文件格式
对编辑和存储的结合位点、分子和药效团进行复杂的文件和存储库管理
tautomers 的智能计数
2、准确、快速的虚拟筛查
高性能、准确的虚拟筛分 具有筛选性能的自动分析 使用 ROC 曲线和富集因子 计算
布尔组合的简单工作流程 靶向和抗靶向药效团模型
易于使用的 AutoDock 4.2 和 AutoDock Vina 实施
准确执行 MMFF94 力 生成高质量几何图形的字段
3、基于配体的药效团设计
基于配体的药效团建模,包括 化学特征自动分类 / 特征权重和排除项的生成 体积球体
通过基于药效团的聚类分析自动选择训练集
闪电小编说明:
对于专业人士和开发团队来说,提供专业且强大的工具以及先进的技术和丰富的经验支持,3D图形用户界面,直观且友好的操作,让整个分析和建模以及设计过程变得更加的清晰,各种筛选过滤选择依据实际需求进行选择,提供自动化优势,更好地评估性能,加上强大的算法支持,对业内人士来说是非常不错的选择。
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