PEAKS®Studio 12破解版是功能强大的下一代工作室平台，蛋白质鉴定和定量软件，PTM和变体搜索解决方案，提供先进的算法和强大的功能，使用最新的 PEAKS 算法进行所有分析，包括数据加载/细化、鉴定和定量。作为 PEAKS Studio 11 的新功能，用户可以选择使用深度学习增强的 ID 工作流程进行 DDA 分析，从而将识别率提高 10% 以上。 Bioinformatics Solutions Inc. (BSI) 隆重发布了 PEAKS
Studio 12！借助最新的质谱技术，BSI 致力于通过提供具有深度学习和突破性算法的蛋白质组学数据分析解决方案来推动相关研究，支持 DDA 和 DIA的非靶向及靶向数据，实现全面的多肽和蛋白质定性定量分析。 最新破解版下载，欢迎有需要的用户来本站下载体验~！
Studio 12！借助最新的质谱技术，BSI 致力于通过提供具有深度学习和突破性算法的蛋白质组学数据分析解决方案来推动相关研究，支持 DDA 和 DIA的非靶向及靶向数据，实现全面的多肽和蛋白质定性定量分析。 最新破解版下载，欢迎有需要的用户来本站下载体验~！
软件特色
1、肽/蛋白质鉴定
从头测序。
使用新的深度学习增强进行数据库搜索，以最大限度地提高肽 ID 效率。
DIA 工作流程（光谱库搜索 + directDB + de novo）。
新功能：使用具有更高灵敏度和准确性的 DIA 数据（包括具有短梯度的 DIA）进行直接数据库搜索。
增强型基于深度学习的技术，用于预测光谱、保留时间和碰撞截面值。
具有 500+ 修饰的翻译后修饰 （PTM） 搜索。
序列变异和突变搜索。
新：基于 DeepNovo 的免疫肽组学肽组学肽组工作流程：将同源性搜索与 de novo 集成在一起，以改善 FDR 控制下的 HLA 肽组学。
新品：PEAKS聚糖模块可实现高灵敏度和准确的糖蛋白组学
2、卓越的无标记和标记定量
无标签和基于标签：TMT（MS2、MS3）/iTRAQ、SILAC、18D 标签、ICAT、用户定义。
可以使用热图、相关性曲线和提取离子色谱图 （XIC） 可视化定量结果。
3、易于使用的界面和卓越的结果可视化
详细且易于使用的图形用户界面 （GUI），用于查看、过滤和验证结果。
光谱库查看器，用于在使用前评估质量并验证库。
以可视化方式呈现的统计计算，以评估原始数据和/或结果的质量。
LC-MS/MS热图可全面显示肽特征、MS/MS谱图采集以及相对于质量过电荷（m/z）、保留时间（RT）、补偿电压（CV）、离子淌度（1/k0）和信号强度的鉴定位置。
4、供应商中立，并经过微调以利用最新的 MS 技术
新功能：PEAKS 11 现在支持 ZenoTOF。
支持离子淌度光谱蛋白质组学（timsTOF Pro、FAIMS、HDMSe）。
针对每种仪器和碎片类型对算法进行了微调，以确保最佳的准确性和灵敏度。
全面支持 DDA 和 DIA 进行鉴定和定量分析。
软件功能
1、基于特征的鉴定工作流程，可提高灵敏度并最大限度地提高肽鉴定效率。
专为 DDA 技术设计，可提高可重复性。
集成数据库搜索和从头测序，以扩展深入分析。
在PEAKS DDA工作流程中激活深度学习提升，以最大限度地提高肽鉴定效率。
2、通过直接数据库搜索 DIA 简化工作流程
DIA 分析是 DDA 工作流程的一种有吸引力的替代方案。过去，DIA方法依赖于从DDA生成谱库来鉴定和定量肽。PEAKS Studio 11 提供独特的 DIA 工作流程，通过集成三种方法（谱库搜索、直接数据库搜索和从头测序）最大限度地提高肽的鉴定率。
针对预定义的谱库执行谱库搜索。没有谱库匹配的肽谱图可以直接在蛋白质数据库中搜索。
使用DIA数据直接搜索蛋白质序列数据库。先进的机器学习算法可以提高肽鉴定的准确性和灵敏度。在管道的这一步中，PEAKS 11 DIA 工作流程现在支持识别用户指定的任何 PTM。这将能够提高修饰肽的鉴定，而无需将其输入谱库。
数据库搜索中不匹配的谱图是从头测序的。
从谱库搜索和蛋白质序列数据库搜索中鉴定出的肽可用于定量分析。
注意：所有 3 种检索方法、PEAKS 谱库检索、直接数据库检索和从头测序都是可选的，工作流程的步骤可以独立进行，也可以按顺序进行。
3、PEAKS DeepNovo 肽组学：免疫肽组学高级解决方案
这种新开发的解决方案是肽组学数据的专用工作流程，结合了数据库搜索、从头测序和突变肽鉴定。
4、离子淌度可实现定量，以最大限度地减少缺失值并提高准确性
5、PEAKS糖基模块插件使科学家能够确定糖基位点定位和糖基结构
PEAKS糖模块是一个全面的数据分析工具，它提供了一个高度灵敏和准确的糖蛋白组学软件解决方案，以促进我们对糖蛋白组的理解。了解更多信息
全面了解糖基化和糖蛋白
用于深度糖谱分析的高级糖蛋白组学
用于聚糖和糖肽定量的创新软件工具
6、质量控制 （QC） 功能，用于从原始数据到结果的深入分析
借助PEAKS® Studio 11中新的质量控制（QC）分析功能，用户可以评估原始数据和/或结果的统计信息，并深入了解LC-MS采集的属性。该自动化工具专为 DDA 和 DIA 数据而设计，将提供用于确定数据质量并评估实验设置的元素。
7、肽特征视图
从数据细化到鉴定和定量，PEAKS 11系列都是基于肽特征的。肽特征包括一系列相应的m/z值、保留时间范围、不同分子亚型形成的强度以及作为第四维信息的离子淌度。
在PEAKS鉴定结果中，用户将找到一个“特征”选项卡，该选项卡以可视化和表格方式显示原始数据中每个肽特征的所有详细信息。在肽特征表中，PEAKS可以方便地总结从LC-MS或LC-IMS/MS中检测到的特征详细信息，包括通过数据库搜索、DDA或从头测序确定的已识别序列。每个特征还与其相应的蛋白质视图、光谱视图和LC-MS或LC-IMS/MS视图相关联，以便进一步检查。
8、蛋白质视图
蛋白质视图可在 DDA 和 DIA 工作流程中对复杂生物样品进行蛋白质分析。对于每种蛋白质，序列覆盖视图都会显示带有谱注释的肽图，以便进行验证。使用PEAKS传统的从头辅助数据库搜索，用户可以轻松查看已识别的蓝色肽序列，而灰色条表示仅从头标签匹配。
9、肽视图
肽视图提供了 MS1 丰度的已鉴定肽列表。对于每个修饰肽，修饰位点的置信度 （Ascore） 是相关的。
10、量化视图
借助 PEAKS Q 的附加模块，PEAKS Studio 还可以同时测定一组样品的相对蛋白质丰度变化，而无需事先了解所涉及的蛋白质。
闪电小编说明：
为发现蛋白质组学提供完整的解决方案，包括蛋白质鉴定和定量、翻译后修饰（PTM）和序列变异（突变）的分析，以及肽/蛋白质从头测序。可使用串联质谱（LC-MS/MS）对复杂蛋白质混合物中的肽/蛋白质进行系统鉴定和定量。使用PEAKS，直接从质谱仪加载原始LC-MS/MS数据（无需先转换数据），并从PEAKS工作流程中进行选择，以执行肽和蛋白质鉴定（如从头测序、数据库和谱库搜索）、PTM和突变表征以及定量。交互式界面还提供了一个详细、易于使用的用户界面，用于数据可视化、结果验证和报告。软件无法下载？不知道解压密码？微信关注订阅号"闪电下载"获取
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