软件标签:Spectronaut
Spectronaut破解版是一个商业软件包,旨在分析数据独立获取(DIA)蛋白质组学实验。 全新建库策略可以整合所有类型谱图库,可通过独立矫正各个谱图库来保证各自的统计准确性。整合数据,提高工作效率,减少成本投入,Spectronaut可以在一个实验中定量分析数百到数千种蛋白质。可以分析具有多种条件的大型实验和由多达数万次LC-MS运行组成的重复。Spectronaut可以在不使用保留时间校准试剂盒的情况下分析DIA数据。然而,强烈建议添加iRT试剂盒,因为它可以确保在困难的基质上进行校准,并允许进行详细的质量控制读数。最新破解版下载,欢迎有需要的朋友下载体验!
Spectronaut 19 在定量、蛋白质组深度和可扩展性方面实现了重大飞跃。在引擎盖下,我们在集成到Spectronaut 19中的AI模型方面取得了实质性进展,从而提高了检测差异丰度肽和蛋白质的能力。
2、安装程序,默认安装完成即可,完成后运行一次立即关闭
3、将Spectronaut.exe和Spectronaut.dll 两个文件复制替换到Spectronaut软件安装目录,替换同名文件
Spectronaut 19 在定量、蛋白质组深度和可扩展性方面实现了重大飞跃。在引擎盖下,我们在集成到Spectronaut 19中的AI模型方面取得了实质性进展,从而提高了检测差异丰度肽和蛋白质的能力。
Spectronaut 19新功能
破纪录的鉴定:Spectronaut 19 为您带来比以前更多的鉴定。
更多生物学相关靶点:通过更灵敏地发现候选物,使您的实验更具可操作性。
对前组学工作流程的扩展支持: 改进了对 plexDIA 工作流程的支持,包括特定通道的条件设置和基于通道的差异分析。
通过改善 RAM 消耗来简化大规模实验: 解决现代大规模蛋白质组学分析的主要挑战之一。
更好的云支持: 新的工作流使云支持更加高效。
Spectronaut继续提供破纪录的蛋白质鉴定率。与Spectronaut 18相比,第19版的蛋白质鉴定平均增加了10%,前体鉴定增加了14%,CV鉴定率分别提高了10%和16%,<20%)。
您可以确信,使用Spectronaut在不同的仪器、梯度长度、样品类型和复杂度上获得最佳的蛋白质覆盖率。
大多数DIA实验的目标是发现差异表达的分析物。为了对此进行基准测试,我们在 10 种不同的条件下以不同的数量将“拟南芥”和“秀丽隐杆线虫”加入“智人”背景中。CQE在布鲁克的timsTOF HT上以三种不同的梯度重复。
使用Spectronaut 19,每次分析都能在不同的梯度长度和倍数变化(无论大小)上提供更多生物学相关的靶标。由于对候选物的发现更敏感,这使得实验更具可操作性。
Spectronaut 19 引入了对 plexDIA 工作流程的扩展支持,包括通道特定条件设置和基于通道的差分分析,以及通道级 FRD 控制的新选项。
使用 Spectronaut 19 进行分析改进了 3 重二甲基标记样品 (M. Thielert et.al., Mol Syst Biol 2023) 和 3-plex mTRAQ (J. Derks et al., Nature Biotechnology 2023) 的通道 ID 和蛋白质组的鉴定。
这个新版本的Spectronaut还为对角线对PASEF的分析提供了新的支持,并通过引入输入函数和PTM化学计量法的归一化,扩展了对PTM工作流程的支持。
使用Spectronaut 19,您现在可以显著改善RAM消耗,从而简化大规模实验。
这是 Spectronaut 19 为应对现代大规模蛋白质组学分析挑战而提供的众多改进之一。
更新日志
1 directDIA 的重大改进
• 评分提高:基于大量且多样化的 DIA 数据集,平均蛋白质组增加 10%,前体增加 13%
• 量化提高:基于大量且多样化的受控定量实验,真实候选物增加 11%。
2 由 AI 提供支持
• 深度学习模型的关键性能指标提高高达 40%
• 可选择使用 deepQuant,这是一种基于深度学习的干扰校正算法
• 改进了对一系列修饰和标签(如二甲基化、泛素化、mTRAQ 等)的推理。
3 计算性能显著提高
• 与 Spectronaut 18.0 相比,directDIA 在 timsTOF 和 Astral 数据上的速度提高了 40%
• 减少了 directDIA RAM 使用量:内存增长减少了 90%。理论上,使用 directDIA plus
SNECombine 工作流程,512 GB RAM 即可处理 10,000 个
样本。
• Spectronaut 保存的实验 (.SNE) 文件大小减少了高达 80%
• 临时硬盘要求降低了高达 86%(来自 HTRMS 的 directDIA)
• 临时硬盘要求降低了高达 50%(来自原始供应商格式的 directDIA)
4 新的采集方法支持
• Bruker 的 timsTOF 平台上的 diagonal-PASEF 支持 directDIA 和基于库的分析
• 分析视角中 diagonal-PASEF 的新可视化
5 改进了对标记 DIA 工作流程的支持
• 增加了对运行级别通道 q 值的支持
• 在通道级别注释生物条件
第 4 页,共 4 页
-Biognosys Confidential 6 用于分析翻译后修饰的新功能
• 通过将富集实验与非富集实验联系起来进行输入标准化
• 支持站点占用率计算
• 分析和后分析视角中的新可视化
7 改进的命令线路接口
• 新的 SNEMerge 选项便于批量或并行处理:将多个
SNE 文件合并为一个 SNE 文件
• 输入标准化的新选项
• 如果命令有错误,则立即退出
• 为每个管道使用具有明确选项范围的单独命令
• 增强了 POSIX 兼容性
8 个新的可视化和报告
• 洗脱组级别 EG.InputNormalizationFactor
• 洗脱组级别 EG.QuantityPerProtein
• PTM 位点报告 PTM.QuantityPerProtein
• PTM 位点报告 PTM.InputNormalizationFactor
• PTM 位点报告 PTM.Stoichiometry
• 新的 R.PTMSites 类别列出了每个 PTM 的所有已识别位点
• 肽与蛋白质数量图
• 分析后分析概述平均 PTM 本地化
• 实验设置中的样本链接页面
9 个新的和更改的分析设置
• [新] DIA 分析 PTM 工作流程 输入标准化策略
• [新] DIA 分析 PTM 工作流程 PTM 定位 化学计量学
计算策略
• [新] DIA 分析 定量 DeepQuant 校正 [测试版]
• [新] DIA 分析 工作流程 混合 (DDA + DIA) 库
• [新] directDIA Pulsar 搜索 加速 diaPASEF 处理 快速
• [新] directDIA Pulsar 搜索 识别 directDIA 工作流程 RT
采样减少
• [更改] Spectronaut 19 仅使用 MS2 定量进行差异丰度分析。
以前,默认同时使用 MS1 和 MS2
安装激活教程
1、在本站下载并解压,如图所示2、安装程序,默认安装完成即可,完成后运行一次立即关闭
3、将Spectronaut.exe和Spectronaut.dll 两个文件复制替换到Spectronaut软件安装目录,替换同名文件
默认:C:\Program Files (x86)\Biognosys\Spectronaut\bin
闪电小编说明:
功能强大的DIA实验数据分析研究解决方案!为DIA研究提供更大的便利,将目前多个独立的DIA相关分析流程进行了无缝整合,更好的扩展了Spectronaut的应用领域。
软件无法下载?不知道解压密码?微信关注订阅号"闪电下载"获取
本帖长期更新最新版 请收藏下载!版权声明:本站提的序列号、注册码、注册机、破解补丁等均来自互联网,仅供学习交流之用,请在下载后24小时内删除。